皮膚と、鼻などの呼吸器期間にトラブルが生じているようですね。
皮膚に関しては、なぜふけが出るようになったのかということを考えていただくことが必要だと思います。赤味など炎症を起こしてしまったり、痒がっているような状況でもないということならば、うさぎさんの生活環境を見直してあげることで、回復することも少なくないですからね。生活のリズムがいつもとは異なっていたりして、ストレスがないかなど見直してみてください。
そして、鼻水が長い間見られていたようですね。私たちの感覚で捉えてしまうと、鼻水程度・・と感じてしまいますが、うさぎは鼻で呼吸しますので、鼻水が出ているだけでも、大変苦しい状況ではあるのですよ。そして、これがもとで大病に繋がることも少なくないですから、しっかりと治療して改善できるように頑張ってもらいたと思います。
闘病や投薬が、うさぎさんにとってもストレスの原因ともなっているのでしょうね。ですが、今この治療は必要なことでもありますよね。そして、ケージを変えたという大きな飼育環境の変化もあります。どちらがどうということよりも、様々なことが重なってしまったということなのかもしれません。そして、夏を過ぎた今だからこそ、体調が思わしくないということもあるでしょうからね。
なんとか食事をとってもらえるよう、うーたろう様が直接与えるなどしたりしていただきたいかと思います。そして、それでも食べないことが続くようですと、強制給餌なども必要になりますからね。担当の獣医師にも、まずは電話で今の状態をご報告して、ストレスをなるべくかけずに改善できる方法をご相談されるとよいかと思いますよ。