そうですね、ネザーなどの立ち耳うさぎの場合、通常でしたら飼い主さんが特にその掃除の手伝いをしてあげなくともよいことのほうが多いのかもしれません。垂れ耳うさぎに比べると汚れも溜まりにくいようですので、見える部分をきれいにしてあげるというぐらいのお手入れでよいのかもしれませんよね。ただ、今回の場合ですと、うさぎさんが自ら耳掃除をすることが困難な状態であるということのようですよね。こういった時には、飼い主さんがその手助けをしてあげることも必要になってくるのだと思います。
ですがまず先に、きちんと獣医師に診せていただくことが必要のようですね。普段は耳垢などあまり見られないものなのですから、それが目立ってきていることと、痒がった仕草を見せていることなど、耳にもトラブルが起きている可能性があるようですよ。原因をしっかりつきとめていただいて、それにあった治療や対処を行うことが一番ですからね。そして実際にうさぎさんを前にして、獣医師からお手入れの方法を伝授していただくことがよろしいと思いますよ。